相對于其他三個保稅區(qū)，坪山新區(qū)保稅區(qū)的明顯優(yōu)勢在于： 
1、可做深加工，此保稅區(qū)是深圳唯一享有此政策的保稅區(qū)。
2、時效性更強，出口貨物不需要換港車經(jīng)過香港，隨到隨走。 
3、退稅更及時。
1、免征企業(yè)流轉環(huán)節(jié)的增值稅和消費稅；外匯管理寬松；進口設備全額保稅，不實行免稅額度控制，國內采購的貨物視同出口，實行入?yún)^(qū)退稅政策。


2、實現(xiàn)“境內關外”管理，海關實行“一次報關，一次審單，一次查驗”通關管理模式，通過預約加班的方法，區(qū)內企業(yè)實現(xiàn)24小時通關的要求。
國內的加工企業(yè)，按照海關對加工企業(yè)監(jiān)管規(guī)定，加工企業(yè)生產(chǎn)出的成品必須限期出口核銷，如果該產(chǎn)生在國內欠缺或有較大的市場，即可轉為內銷。另有一部分貿易公司，因業(yè)務需要，向國內加工企業(yè)訂購貨物，但因加工貿易手冊管理需要，只能在香港交貨，也存在內銷情況。
  產(chǎn)品出口時，一般國內加工企業(yè)的做法都是先將產(chǎn)品出口至香港，然后再從香港進口到國內，雖然此舉達到了出口轉內銷的目的，但產(chǎn)生了較高的成本費用。其實，企業(yè)完全可以利用物流園區(qū)作為出口轉內銷的快捷通道。國內加工企業(yè)將產(chǎn)品運進物流園區(qū)即可實現(xiàn)核銷，當國內的銷售商或廠商需進口該產(chǎn)品時可直接從物流園區(qū)提貨，這樣，加工企業(yè)就可省下一筆可觀的費用開支。


轉廠流程如下：  
1.出口方貨柜車輛到達前一天將詳細出貨報關資料提交我行做預錄入。
發(fā)票————裝箱單——-手冊表頭表體——-申報要素——-代理報關委托書，如需商檢，請?zhí)峁┩P單或商檢換證憑條、代理報檢委托書、自理報檢備案號、營業(yè)執(zhí)照復印件等其他資料。
2.同時進口方也提交詳細進口報關資料給我司做預錄入。
合同——-發(fā)票——裝箱單————手冊表頭表體——-報關委托書，如需商檢，請?zhí)峁┳岳韴髾z委托書、自理報檢備案號、營業(yè)執(zhí)照復印件等其他資料
3.貨柜車開至海關監(jiān)管場前，提前聯(lián)系我司報關員。按指引進出監(jiān)管區(qū)。
4.我司開始向海關正式申報進出口報關操作。其中，出口報關完成，貨柜車出監(jiān)管區(qū)至保稅區(qū)兜圈等報關員通知進來，完成進口報關審批。
    5.進口審批，如遇查車檢驗，一定要配合海關操作，驗核完成，等報關員通知放行后，按指引出區(qū)。
即整個轉廠（一日游）流程完成。
一般三小時即可完成出口再進口，貨車啟運進口方倉庫。